Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NPRL3Q12980 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms