Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCGQ13326 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCGQ13326 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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SGCGQ13326 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SGCGQ13326 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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