Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SYCP1Q15431 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SYCP1Q15431 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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