Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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