Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms