Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TTPAP49638 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TTPAP49638 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TTPAP49638 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms