Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SYCP1Q15431 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms