Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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