Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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