Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Q6P435 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Q6P435 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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