Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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