Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r10W4VSP8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r10W4VSP8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms