Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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