Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms