Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms