Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd3Q9Z2D8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mbd3Q9Z2D8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms