Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd4Q9Z2D7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms