Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs4Q9Z1T2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs4Q9Z1T2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms