Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3b1Q9Z1T1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms