Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms