Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx39bQ9Z1N5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms