Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Padi1Q9Z185 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Padi1Q9Z185 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms