Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Padi3Q9Z184 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Padi3Q9Z184 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms