Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn13Q9Z0S4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms