Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip2Q9Z0H8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip2Q9Z0H8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms