Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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