Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChrdQ9Z0E2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms