Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slit3Q9WVB4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slit3Q9WVB4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms