Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn5Q9WU28 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn5Q9WU28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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