Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn4Q9WU22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms