Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrf1Q9WU00 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms