Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv2Q9WTR1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms