Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms