Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms