Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn7Q9R1S8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn7Q9R1S8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms