Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ntn3Q9R1A3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ntn3Q9R1A3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ntn3Q9R1A3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms