Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod1Q9R0E2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms