Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp2Q9R061 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp2Q9R061 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms