Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AmfrQ9R049 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmfrQ9R049 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms