Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms