Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps29Q9QZ88 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps29Q9QZ88 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms