Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vnn3Q9QZ25 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vnn3Q9QZ25 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms