Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nphp1Q9QY53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms