Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan3Q9QY33 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Tspan3Q9QY33 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tspan3Q9QY33 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tspan3Q9QY33 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tspan3Q9QY33 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms