Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn4Q9QXZ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn4Q9QXZ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms