Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr2e3Q9QXZ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms