Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip4Q9QXN3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms