Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copg2Q9QXK3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg2Q9QXK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms