Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Limd1Q9QXD8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms