Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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